Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms