Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APAF1O14727 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APAF1O14727 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APAF1O14727 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APAF1O14727 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APAF1O14727 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APAF1O14727 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APAF1O14727 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APAF1O14727 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APAF1O14727 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APAF1O14727 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APAF1O14727 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APAF1O14727 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APAF1O14727 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APAF1O14727 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APAF1O14727 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APAF1O14727 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APAF1O14727 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APAF1O14727 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
APAF1O14727 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
APAF1O14727 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms