Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms