Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
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