Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KR12 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KR12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KR12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KR12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KR12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KR12 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3KR12 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3KR12 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KR12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KR12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3KR12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms