Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PMD0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PMD0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PMD0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PMD0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PMD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PMD0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PMD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PMD0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PMD0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PMD0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PMD0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PMD0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PMD0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms