Protein–RNA interactions for Protein: E9PAM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PAM4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PAM4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PAM4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PAM4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PAM4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PAM4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PAM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PAM4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PAM4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PAM4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PAM4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PAM4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PAM4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms