Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms