Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms