Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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