Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KNCNA6PVL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms