Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HELTA6NFD8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms