Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRD1A4D1F6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms