Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSC5DA1L4H1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSC5DA1L4H1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSC5DA1L4H1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms