Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms