Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WWV3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WWV3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms