Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ANKRD27-207ENST00000590519 1067 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TCHP-204ENST00000537218 853 ntTSL 216.59■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 316.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FLCN-210ENST00000577591 296 ntTSL 216.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-210ENST00000488485 1884 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NAA10-214ENST00000482485 1075 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 LRRC8C-204ENST00000482063 504 ntTSL 316.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF487-201ENST00000315429 568 ntAPPRIS P1 TSL 216.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-208ENST00000527187 1441 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 JARID2-203ENST00000474854 520 ntTSL 316.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-204ENST00000414117 723 ntTSL 516.19■□□□□ 0.184e-14■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-208ENST00000481472 411 ntTSL 416.18■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-211ENST00000580078 816 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 COASY-207ENST00000587214 539 ntTSL 416.09■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CEP57L1-211ENST00000520610 1120 ntTSL 516.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-203ENST00000507415 423 ntTSL 315.97■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 515.97■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PHYKPL-206ENST00000476487 2251 ntTSL 215.96■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-203ENST00000447047 842 ntTSL 515.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FNTB-203ENST00000554334 2622 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 COASY-203ENST00000585811 625 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UBAC2-211ENST00000494576 1855 ntTSL 215.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 GABBR1-218ENST00000491829 4212 ntTSL 515.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 COASY-204ENST00000585909 570 ntTSL 215.72■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CORO7-205ENST00000570928 540 ntTSL 515.71■□□□□ 0.112e-10■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FNTB-206ENST00000555742 725 ntTSL 515.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 BLMH-212ENST00000582749 769 ntTSL 215.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 OS9-212ENST00000550202 787 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 COASY-205ENST00000586771 742 ntTSL 315.6■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RAD51C-211ENST00000487525 1253 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DECR2-215ENST00000633025 561 ntTSL 515.58■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 415.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-231ENST00000534382 764 ntTSL 415.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-207ENST00000508075 965 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CEP57L1-206ENST00000518329 812 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 515.21■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CEP57L1-218ENST00000522461 575 ntTSL 415.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-221ENST00000531502 557 ntTSL 415.16■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FLNA-210ENST00000462590 1026 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 COASY-208ENST00000587858 569 ntTSL 415.1■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 01e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 BLMH-205ENST00000578090 1483 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 HBP1-207ENST00000468401 573 ntTSL 415□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CEP57L1-217ENST00000521737 559 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD27-203ENST00000586693 557 ntTSL 314.96□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RAD51C-205ENST00000461271 726 ntTSL 514.85□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SNHG10-203ENST00000554169 981 ntTSL 214.84□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STUB1-203ENST00000564316 729 ntTSL 314.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-211ENST00000545932 3685 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 EIF2B5-214ENST00000492773 553 ntTSL 414.58□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 214.46□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PHYKPL-207ENST00000481436 2025 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PDLIM7-212ENST00000504380 556 ntTSL 214.34□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TMEM63B-206ENST00000525873 807 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ADAM17-202ENST00000478059 1073 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CEP57L1-220ENST00000522608 769 ntTSL 514.13□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 514.12□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RAD51C-210ENST00000486827 1609 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FNTB-207ENST00000556709 509 ntTSL 513.94□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM104A-207ENST00000583178 563 ntTSL 413.83□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-205ENST00000428174 470 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DCTD-207ENST00000507543 1874 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STAG3L5P-206ENST00000488972 552 ntTSL 413.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 5397.7 ms