Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U3KQE9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U3KQE9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U3KQE9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U3KQE9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
U3KQE9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U3KQE9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms