Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms