Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN10AQ9Y5Y9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN10AQ9Y5Y9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms