Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RAI2Q9Y5P3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAI2Q9Y5P3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms