Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDP1Q9Y5B0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDP1Q9Y5B0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDP1Q9Y5B0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDP1Q9Y5B0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDP1Q9Y5B0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDP1Q9Y5B0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDP1Q9Y5B0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms