Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms