Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms