Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC4Q9Y296 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms