Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms