Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms