Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX6Q9UNH7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX6Q9UNH7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms