Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms