Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRXN1Q9ULB1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN1Q9ULB1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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