Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms