Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HDAC9Q9UKV0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC9Q9UKV0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms