Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms