Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ADAM28Q9UKQ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ADAM28Q9UKQ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms