Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA1Q9UJY5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms