Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSKSQ9UJT2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSKSQ9UJT2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms