Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHORDC1Q9UHD1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms