Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT8Q9UFF9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT8Q9UFF9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT8Q9UFF9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms