Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFDP1Q9UEE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CFDP1Q9UEE9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms