Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJB4Q9UDY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB4Q9UDY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms