Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPASTQ9UBP0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPASTQ9UBP0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms