Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms