Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms