Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIS18AQ9NYP9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms