Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms