Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX43Q9NXZ2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX43Q9NXZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX43Q9NXZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms