Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL28Q9NXS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL28Q9NXS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms