Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MS4A12Q9NXJ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A12Q9NXJ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms