Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CWC25Q9NXE8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CWC25Q9NXE8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1504.5 ms