Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms